Не знаю,честно.
Сын сказал, что закваска на ржаной муке просто получается вкуснее и ароматнее.
Можно ведь попробовать, правда?
То, что не такая активная, может оказать влияние на время всхожести.
Кроме этого не вижу причины, почему её нельзя использовать в данном случае.